Para su funcionamiento, el CCT CONICET San Luis consta de un Consejo Directivo y un Consejo Asesor.
El Consejo Directivo tiene como labor principal coordinar la labor científica, diseñar la política de servicios y supervisar las tareas administrativa de la Unidad de Administración Territorial del CCT.
Dirección:
- Director : Dr. Antonio José Ramírez Pastor
- Vicedirector : Dr. Ricardo Daniel Enriz
Integrantes del Consejo Directivo:
- Dr. Hugo Velasco - director del IMASL
- Dr. Luis Cadús - director del INTEQUI
- Dr. Daniel Enriz - director del IMIBIO-SL
- Dr. Ariel Ochoa - director interino del INFAP
- Dra. Soledad Cerutti - director del INQUISAL
El Consejo Asesor se compone de:
- Cámara Industrial San Luis
- INTA San Luis
- Municipalidad de la Ciudad de San Luis
- Sociedad Rural San Luis
- Municipalidad de Villa Merlo
- Universidad Nacional de San Luis
- Universidad Católica de Cuyo
- Universidad de La Punta - representando al gobierno de la Provincia de San Luis